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目前，對微波加熱機理的探討很多，大多數都是從傳統的電磁波物理學理論出發對其加以解釋的，可簡單地描述如下：分子在微波的輻射下(電場的作用下) ，轉向偶極矩發生變化，由於摩擦產生熱量。在微波加熱的情況下，熱量來自分子本身，這和傳統的加熱方式--熱量來自熱源并經過物質的熱傳導有明顯的區別。微波加熱具以下顯著的特點：
1) 和傳統的加熱方式相比，所用有機溶劑更少，甚至可以不采用有機溶劑
2) 熱傳導、對流性質不好的物質可以在短時間內的以加熱，均勻性更好；
3) 可以對目標物“選擇性" 地進行加熱，加熱效率高、更節省能量；
4) 可以對熱損失系數較大的物質選擇性地進行加熱；
5) 熱傳導較差和幾何形狀不規則的物質可以在短時間內得以加熱；
6) 可以通過感應器來對溫度進行控制，反應自動化程度得以提高；
7) 密閉加熱，可以進行有壓力反應和排除空氣干擾。
微波與化學合成
微波技術用于化學合成早可追溯到1986年，當時加拿大的R.Gedye等實驗中發現：和傳統的加熱方式如電加熱、油浴加熱相比，微波輔助化學合成的反應速度大大的得以提高。此外，由于微波反應還具有重現性高、環保、選擇性高等諸多特點，迅速引起了人們的廣泛關注。自90年代后半期以來，有關微波合成的報導逐年呈上升趨勢，至今已有1000多篇相關報導。事實上，現在有機合成類代表性雜志如Tetrahedron Letters,Synlett等基本上每期上都刊登有微波合成的文章。